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重慶市中醫(yī)院始建于1902年，是中國(guó)近代第一家國(guó)立中醫(yī)院，曾開創(chuàng)國(guó)立中醫(yī)急癥的先河。1955年，首任院長(zhǎng)吳棹仙老先生向毛主席敬獻(xiàn)“子午流注環(huán)周圖”，成為中國(guó)中醫(yī)藥歷史上的標(biāo)志性事件，在全國(guó)中醫(yī)界影響深遠(yuǎn)。
我院是重慶市規(guī)模最大、實(shí)力最強(qiáng)，集醫(yī)療、教學(xué)、科研、公益四項(xiàng)中心職能于一體的大型三級(jí)甲等中醫(yī)醫(yī)院，是國(guó)家中醫(yī)疫病防治隊(duì)伍及疫病防治基地依托中醫(yī)醫(yī)院、首批國(guó)家中醫(yī)藥傳承創(chuàng)新工程重點(diǎn)中醫(yī)醫(yī)院建設(shè)單位、國(guó)家中醫(yī)藥傳承創(chuàng)新中心建設(shè)單位、國(guó)家中醫(yī)康復(fù)中心建設(shè)單位，也是全國(guó)首批中醫(yī)住院醫(yī)師、全科醫(yī)生規(guī)范化培訓(xùn)基地，國(guó)家級(jí)住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)重點(diǎn)專業(yè)基地（中醫(yī)全科）。2023年，醫(yī)院正式成為重慶中醫(yī)藥學(xué)院附屬第一醫(yī)院。
醫(yī)院現(xiàn)有江北區(qū)南橋寺院部和渝中區(qū)道門口院部，占地173畝，建筑面積20萬(wàn)方，床位2500張，設(shè)有臨床科室44個(gè)，醫(yī)技科室10個(gè)，年門（急）診患者340萬(wàn)人次，年出院患者8.4萬(wàn)人次。擁有國(guó)家臨床重點(diǎn)�？�5個(gè)，國(guó)家區(qū)域中醫(yī)診療中心2個(gè)，國(guó)家中醫(yī)藥管理局高水平重點(diǎn)學(xué)科和重點(diǎn)專科共11個(gè)，國(guó)家中醫(yī)優(yōu)勢(shì)�？�10個(gè)，市級(jí)重點(diǎn)學(xué)（專）和名科群51個(gè)，重慶市中醫(yī)特色診療中心建設(shè)項(xiàng)目組長(zhǎng)單位和副組長(zhǎng)單位9個(gè)，重慶市中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)療中心3個(gè)，重慶市醫(yī)療質(zhì)量控制中心17個(gè)，市級(jí)臨床診療中心1個(gè)，是國(guó)家（重慶）中醫(yī)康復(fù)示范中心、重慶市中醫(yī)護(hù)理臨床技術(shù)指導(dǎo)中心和重慶市中醫(yī)治未病中心。
醫(yī)院獲批國(guó)家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)研究室、國(guó)家級(jí)診斷鑒定機(jī)構(gòu)、重慶市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、市衛(wèi)健委重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、重慶市中醫(yī)特色診療工程技術(shù)中心、重慶市皮膚病臨床醫(yī)學(xué)研究中心、重慶市中醫(yī)臨床研究基地、重慶市中醫(yī)藥循證醫(yī)學(xué)中心、重慶市中醫(yī)藥轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心等國(guó)家級(jí)、市級(jí)科研平臺(tái)16個(gè)。建成中國(guó)-新加坡中醫(yī)藥國(guó)際合作基地（重慶）、中國(guó)-巴巴多斯中醫(yī)藥中心、重慶市院士專家工作站、國(guó)家級(jí)和重慶市博士后科研工作站（獨(dú)立招收）、中醫(yī)藥傳承博士后工作站。累計(jì)牽頭承擔(dān)各級(jí)各類科研項(xiàng)目2000余項(xiàng)，科研經(jīng)費(fèi)超2.5億元。醫(yī)院研制了參麥注射液、丹桃合劑、降糖丸、更年寧心膠囊等多個(gè)國(guó)家新藥，獲批醫(yī)院制劑192種。同時(shí)，醫(yī)院是中國(guó)中醫(yī)藥文獻(xiàn)檢索中心重慶分中心、全國(guó)針灸臨床中心重慶分中心，辦有《中國(guó)中醫(yī)急癥》雜志。重慶市中醫(yī)藥學(xué)會(huì)、重慶市中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會(huì)、重慶市針灸學(xué)會(huì)和重慶市中醫(yī)藥行業(yè)協(xié)會(huì)均掛靠醫(yī)院。
醫(yī)院在崗職工近3500人，擁有國(guó)醫(yī)大師2人，全國(guó)名中醫(yī)3人，國(guó)家青年岐黃學(xué)者1人，全國(guó)名老中醫(yī)藥專家傳承工作室專家12人，國(guó)務(wù)院政府特殊津貼專家9人，重慶市學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人、重慶市首席醫(yī)學(xué)專家等市級(jí)人才63人，重慶市名中醫(yī)、巴渝岐黃學(xué)者等市級(jí)中醫(yī)藥類人才140余人。高級(jí)職稱專家628人，碩博士導(dǎo)師104人，博士及在讀博士297人。累計(jì)招收培養(yǎng)博士后157人，現(xiàn)有在站博士后99人。
醫(yī)院先后榮獲全國(guó)五一勞動(dòng)獎(jiǎng)狀、全國(guó)創(chuàng)先爭(zhēng)優(yōu)先進(jìn)基層黨組織、全國(guó)文明單位、全國(guó)精神文明建設(shè)先進(jìn)單位、全國(guó)衛(wèi)生系統(tǒng)先進(jìn)集體、全國(guó)中西醫(yī)結(jié)合先進(jìn)單位、全國(guó)平安醫(yī)院工作表現(xiàn)突出集體、原衛(wèi)生部抗震救災(zāi)先進(jìn)集體、中華全國(guó)總工會(huì)工人先鋒號(hào)、全國(guó)青年文明號(hào)、全國(guó)人文愛心醫(yī)院、全國(guó)中醫(yī)藥應(yīng)急工作先進(jìn)集體、全國(guó)中醫(yī)醫(yī)院優(yōu)質(zhì)護(hù)理服務(wù)先進(jìn)單位等榮譽(yù)100多項(xiàng)。2010年12月6日，時(shí)任中共中央政治局常委、中央書記處書記、國(guó)家副主席習(xí)近平視察了醫(yī)院，勉勵(lì)醫(yī)院繼續(xù)努力，把工作做得更好。