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新華醫(yī)院占地面積261畝（含奉賢院區(qū)約152畝），總體建筑面積25.6萬平方米，學科設置齊全，特色鮮明，共有內(nèi)、外、婦、兒等臨床、醫(yī)技科室及診療平臺60個，開放床位數(shù)2450余張，在職職工3940余人，其中醫(yī)護人員2840余人。是全市三級醫(yī)院中唯一一所同時擁有圍產(chǎn)和完整兒科亞專業(yè)的綜合性醫(yī)院，為首批國家級兒童早期發(fā)展示范基地。
新華醫(yī)院建設有設施完備的急診大樓、門診與內(nèi)科大樓、外科大樓、醫(yī)療保健綜合樓、兒科綜合樓、小兒外科大樓、婦兒樓、口腔皮膚科樓和醫(yī)技樓，為病人提供了舒適的就醫(yī)環(huán)境。TOMO、達芬奇手術機器人、PET-CT、DSCT（雙源CT）、SPECT、LA、DSA、MRI、集成激光超聲介入系統(tǒng)、氬氦低溫手術系統(tǒng)、移動式術中磁共振成像系統(tǒng)、高壓（低壓）氧治療艙和準分子激光等醫(yī)療設備確保了診斷和治療的質(zhì)量。
醫(yī)院普通外科、心臟大血管外科、小兒外科、急診醫(yī)學科、耳鼻咽喉頭頸外科、皮膚科、兒內(nèi)科小兒呼吸專業(yè)、中醫(yī)兒科、檢驗科和臨床藥學等10個學科位列國家臨床重點專科建設項目。上海·中國遺傳醫(yī)學中心新生兒篩查和遺傳代謝部、上海市小兒外科臨床醫(yī)學中心、上海市危重孕產(chǎn)婦會診搶救中心、上海市危重新生兒會診搶救中心、上海市產(chǎn)前診斷中心、上海市兒童聽力障礙診治中心、上海市新生兒先天性心臟病篩查診治中心、上海市罕見病診治中心、上海市兒童罕見病診治中心等9個省部級診治及搶救中心，以及8個上海交通大學診治中心設置在新華醫(yī)院。
上世紀50年代，新華醫(yī)院成功進行了我國第一例嬰兒心內(nèi)直視手術，80年代，成功進行我國第一例連體兒分離術。此外，醫(yī)院還在國內(nèi)率先開展了白內(nèi)障囊內(nèi)冷凍摘除術、先天性巨結(jié)腸根治術、先天性多囊腎專項減壓術，首先應用酶有道劑治療體原性黃疸，在國內(nèi)率先實施駝背脊柱側(cè)彎矯治術，率先開設小兒哮喘�？崎T診等。在醫(yī)學科研發(fā)展、服務創(chuàng)新進步的道路上，新華醫(yī)院始終沒有停下探索的腳步，薪火相傳，不斷前行。
新華醫(yī)院擁有環(huán)境與兒童健康教育部和上海市重點實驗室、上海市小兒消化與營養(yǎng)重點實驗室和上海市兒科醫(yī)學研究所等國家及上海市重點學科或研究基地共計12個。近年來共獲得省部級以上科研獎項20項；國家百千萬人工程、教育部新世紀人才、上海市領軍人才、上海市優(yōu)秀學術帶頭人等市級以上人才項目144項；國家級科研項目324項，發(fā)表SCI文章1431篇。設有新華臨床醫(yī)學院以及上海交通大學醫(yī)學院臨床醫(yī)學系、臨床營養(yǎng)系、兒科學系、耳鼻咽喉科學系四個醫(yī)學教育學系，現(xiàn)有博士生導師94名、碩士生導師138名。醫(yī)院主辦的專業(yè)學術期刊《臨床兒科雜志》和《教育生物學雜志》被多家國際檢索數(shù)據(jù)庫收錄。
2015年，新華醫(yī)院正式成立臨床研究中心，該中心是上海第一家基于醫(yī)院的臨床研究系統(tǒng)化支撐創(chuàng)新平臺性機構(gòu)，與加拿大渥太華大學醫(yī)學院和美國哈佛醫(yī)學院深度合作，匯聚醫(yī)生、臨床流行病學家、臨床藥師、統(tǒng)計學家，遵循國際化的科學水平和倫理標準，搭建了臨床研究的協(xié)作網(wǎng)絡，推動臨床研究項目的質(zhì)量提升，并為臨床醫(yī)學研究成果的轉(zhuǎn)化提供規(guī)范化途徑，充實了臨床研究人才庫。
在臨床研究中心的支撐下，依托上海交通大學醫(yī)學院生命早期健康研究院，“千天計劃”——國內(nèi)首個探索人類重大發(fā)育源性疾病的航母級臨床研究項目已取得初步進展，該項目在生命早期健康領域的研究成果將有力的推動我國婦幼健康以及相關政策的決策科學水平邁上一個新臺階。
新華醫(yī)院按照上海市郊區(qū)新建三級醫(yī)院“5+3+1”項目的部署，自2009年起全面負責崇明三級醫(yī)院創(chuàng)建工作，帶領分院成功通過三級醫(yī)院評審，并成為國家腫瘤規(guī)范化診治試點醫(yī)院，以新華崇明分院為核心的專科專病醫(yī)聯(lián)體建設取得成效。新華-崇明一體化管理、同質(zhì)化發(fā)展的改革模式得到國家衛(wèi)生計生委的充分肯定和高度評價。2018年起，國務院醫(yī)改辦和上海市政府共同委托新華醫(yī)院牽頭建設“健康版”新華-崇明區(qū)域醫(yī)療聯(lián)合體改革試點工作正式啟動，以醫(yī)保支付體系改革為支點，逐步從“大病不出島”到“健康少生病”的轉(zhuǎn)變，積極探索上海市及全國醫(yī)聯(lián)體建設的新路徑。
在建中的“十四五”重點規(guī)劃項目——新華醫(yī)院奉賢院區(qū)，占地152畝，總床位1200張，一期工程建筑面積約13.5萬平方米，床位600張，將于2024年12月竣工。屆時，新華醫(yī)院將形成“一體兩翼、智聯(lián)互通、平臺支撐、學科融合”的總體發(fā)展格局，為長三角一體化國家戰(zhàn)略提供助力，為奉賢新城建設規(guī)劃發(fā)展提供支撐，為改善郊區(qū)民生提供依托，為加強醫(yī)教研聯(lián)動提供動力。
醫(yī)院還先后牽頭成立了北部兒科醫(yī)聯(lián)體（覆蓋楊浦、虹口、寶山、崇明四區(qū)）和新華-楊浦醫(yī)療聯(lián)合體，形成了以新華為龍頭、以二、三級醫(yī)療機構(gòu)為平臺，以社區(qū)衛(wèi)生服務中心為延伸的格局，將優(yōu)質(zhì)醫(yī)療資源輻射到社區(qū)，在推動分級診療實施中發(fā)揮積極作用。
在全國和上海市抗擊新冠肺炎疫情的工作中，主動承擔公立醫(yī)院社會責任，分批多次派遣醫(yī)務人員援鄂、援公共衛(wèi)生中心，平穩(wěn)運行長興人民醫(yī)院定點救治醫(yī)院、長興島臨時集中隔離收治點、花博園復興館臨時集中隔離收治點，參與國際航班醫(yī)療保障工作和全市核酸檢測工作。在疫情最吃緊的時候，院內(nèi)7路生命救治線始終堅守崗位、保持暢通，傳承新華人“愛民惠民，守護健康”的辦院宗旨。獲上海市抗擊新冠肺炎疫情先進集體、個人。
醫(yī)院在滇、疆、藏等各地扎實開展各項對口支援工作，受上海市委、市政府委托，負責統(tǒng)籌協(xié)調(diào)“喀什地區(qū)第二人民醫(yī)院重點學科建設項目”，喀什第二人民醫(yī)院2015年通過了自治區(qū)三級甲等醫(yī)院評審，打造成為南疆醫(yī)學中心。醫(yī)院于2010年3月與云南省保山市龍陵縣人民醫(yī)院建立了長期對口支援關系，因出色表現(xiàn)被授予“全國城鄉(xiāng)醫(yī)院對口支援工作先進集體”稱號。醫(yī)院普外科積極響應醫(yī)療援藏精準幫扶的號召，自2017年起實行“以院包科”，支持日喀則市人民醫(yī)院創(chuàng)建“三級甲等醫(yī)院”，獲全國脫貧攻堅先進集體稱號。醫(yī)院自60年代起參加我國首批援外醫(yī)療隊后，優(yōu)良傳統(tǒng)延續(xù)至今，上海援摩醫(yī)療隊和援老撾醫(yī)療隊始終有著新華人的身影，發(fā)揚了不畏艱難、救死扶傷和忘我奉獻的精神。
醫(yī)院與美國、法國、加拿大等發(fā)達國家的頂尖醫(yī)院和科研機構(gòu)長期保持友好交流與合作關系，加強在重點醫(yī)療領域的人員交流和學術合作，以項目為依托深化國際交流與合作，支持與協(xié)助新華-渥太華大學醫(yī)學院臨床研究國際合作項目、新華-哈佛多學科合作項目、兒童實體腫瘤團隊與澳大利亞臨床研究合作項目等進入新階段。始終以“共享、共贏、共發(fā)展”為理念指引，努力加強溝通、交流與合作，夯實并拓展可實際落地的協(xié)作領域，形成點面結(jié)合的網(wǎng)格化的國際學術交流布局，以國際化視野助推醫(yī)院醫(yī)、教、研全面發(fā)展。
新華始終堅持公益性辦醫(yī)方向，積極推動區(qū)域兒科醫(yī)療的均質(zhì)化發(fā)展，推動了兒科分級診療體系的初步建立。新華-市東醫(yī)聯(lián)體建設榮獲上海市“創(chuàng)新醫(yī)療服務品牌”。新華醫(yī)院聯(lián)盟從成立至今已有成員單位29家，逐步從松散型合作走向了深度重點合作的模型。在此基礎上，牽頭建立的全國綜合性醫(yī)院兒科聯(lián)盟、長三角兒科醫(yī)學創(chuàng)新聯(lián)盟，基于聯(lián)盟平臺開展的“千天計劃”成果逐增，將繼續(xù)嘗試向互聯(lián)網(wǎng)轉(zhuǎn)型，使新華品牌在互聯(lián)網(wǎng)端得以進一步傳播。