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鄂爾多斯市疾病預(yù)防控制中心是由原伊克昭盟衛(wèi)生所、衛(wèi)生防疫委員會、防疫隊、性病防治站和鄂爾多斯市衛(wèi)生防疫站更替和發(fā)展過來的。1957年原伊克昭盟衛(wèi)生防疫站成立，2001年更名為鄂爾多斯市衛(wèi)生防疫站，2003年又更名為鄂爾多斯市疾病預(yù)防控制中心。2011年中心整體搬遷至康巴什新區(qū)公共衛(wèi)生大廈，總面積9000多平方米，現(xiàn)正新建1.26萬平方米的實驗樓。

市疾病預(yù)防控制中心為鄂爾多斯市衛(wèi)生健康委員會所屬公益一類事業(yè)單位，機構(gòu)規(guī)格正處級。核定領(lǐng)導(dǎo)職數(shù)2正3副，核定編制187個，核定內(nèi)設(shè)機構(gòu)20個�，F(xiàn)有在編在崗人員177名，其中博士研究生2名，碩士研究生35名，本科124名；高級職稱59名，中級職稱47名，初級職稱38名。主要職能職責(zé)為：疾病預(yù)防與控制、突發(fā)公共衛(wèi)生事件應(yīng)急處置、疫情報告及健康相關(guān)因素信息管理、健康危害因素監(jiān)測與干預(yù)、實驗室檢測、檢驗與評價、健康教育與健康促進、業(yè)務(wù)技術(shù)的規(guī)范管理培訓(xùn)與科研項目應(yīng)用研究指導(dǎo)等。

市疾病預(yù)防控制中心現(xiàn)有實驗室總面積3650平方米；有分子生物、艾滋病確證、臨床檢驗、結(jié)核、鼠布、地病等實驗室，其中生物安全二級實驗室14個；能夠檢驗非食品類、食品類、生活飲用水等496項；能夠開展流感病毒雞胚培養(yǎng)、細胞培養(yǎng)以及新冠肺炎病毒核酸檢測、血清學(xué)檢測及基因測序等檢驗?zāi)芰�，同時具備較為完善的突發(fā)公共衛(wèi)生事件應(yīng)急響應(yīng)機制和現(xiàn)場處置能力，實驗室具備突發(fā)中毒事件應(yīng)急監(jiān)測和傳染病病原學(xué)快速檢測能力，可在48小時內(nèi)完成人感染H7N9禽流感、中東呼吸綜合征、新冠和鼠疫等重點病原體的檢測。

近年來承擔(dān)主持國家項目2項、自治區(qū)項目7項、市級項目8項，鄂爾多斯市創(chuàng)新人才團隊3個。在國內(nèi)外發(fā)表論文近100篇，其中SCI論文3篇，申請國家發(fā)明專利9項，編著專著3部。3項科技成果榮獲內(nèi)蒙古科學(xué)技術(shù)進步獎，2項科技成果榮獲鄂爾多斯市科學(xué)技術(shù)進步獎三等獎。

市疾病預(yù)防控制中心在市委、市政府的正確領(lǐng)導(dǎo)下，在上級業(yè)務(wù)部門和市衛(wèi)健委的有力指導(dǎo)下，認真貫徹自治區(qū)和我市重大決策部署，抓重點、補短板、強弱項，各項工作取得新成績。先后獲得國家級表彰8次，自治區(qū)級表彰59次。2022年被評為甲類A級疾病預(yù)防控制機構(gòu)。