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安徽醫(yī)科大學第二附屬醫(yī)院是一所集醫(yī)療、教學、科研、預防、保健、康復等多功能于一體的三級甲等現(xiàn)代化綜合性醫(yī)院。醫(yī)院于2008年開診，2013年率先在安徽省按照原衛(wèi)生部部頒標準通過國家三級醫(yī)院等級評審。2017年初，醫(yī)院以高分通過JCI國際認證（Joint Commission International， 醫(yī)療機構評審聯(lián)合委員會國際部），成為安徽省首家獲得JCI認證、全國第十家以學術型醫(yī)學中心醫(yī)院通過JCI評審的大型公立醫(yī)院。醫(yī)院現(xiàn)擁有1個國家臨床重點�？平ㄔO項目，11個省臨床重點�？疲�其中2022年獲批省重點�？�1個（眼科）；擁有省級臨床研究中心1個，教育廳重點實驗室1個；2023年獲國家自然基金立項33項，位列全國醫(yī)院前五十強。省科技進步獎9項，省級教學成果一等獎1項；9個學科位居中國醫(yī)學院�？萍剂恐等珖�百強；在9月30日國家衛(wèi)生健康委公布的2021年度全國三級公立醫(yī)院績效考核（國考）中獲A+等級，位列全國87名。
近年來，醫(yī)院先后榮獲“全國衛(wèi)生先進單位”“全國創(chuàng)先爭優(yōu)先進基層黨組織”、“全國醫(yī)院文化建設先進單位” “全國城市醫(yī)院思想政治工作先進單位” “全國百姓放心示范醫(yī)院”稱號，連續(xù)四年獲得全國“改善醫(yī)療服務”示范表彰 。2022年，獲全國“公立醫(yī)院高質量發(fā)展示范案例獎”，首次榮獲“安徽省服務行業(yè)居民滿意度調(diào)查”醫(yī)療行業(yè)第一名。2021年獲得“安徽省十佳履行社會責任最滿意單位”、中國現(xiàn)代醫(yī)院管理典型案例等榮譽稱號，醫(yī)院近20名醫(yī)護人員獲得“中國好人”“安徽好人”“合肥好人”“最美醫(yī)生”等榮譽稱號。
醫(yī)院位于安徽省省會合肥，總建筑面積281668平方米。院內(nèi)以科學的流線設計將醫(yī)用、人流、物流科學分開，配以全面集成數(shù)字化信息系統(tǒng)、完善的生活休閑服務設施，構筑了一座花園式、人性化的舒適性醫(yī)院，2018年被評為首屆中國最美醫(yī)院。
醫(yī)院目前開放床位2650張，現(xiàn)有員工3124人，其中高級職稱493人，博士305人，在站博士后43人，教授29人，博士生導師55人，國家百千萬人才工程1人、國家重點人才計劃青年項目入選者1人；國務院特殊津貼5人、省政府特殊津貼4人、國家衛(wèi)生健康突出貢獻中青年專家2人，國家衛(wèi)生計生突貢中青年專家1人、省學術技術帶頭人及后備人選20人、江淮名醫(yī)13人、省杰青3人、優(yōu)青5人、省特支2人、皖江學者特聘教授1人、青年皖江學者2人、省衛(wèi)生系統(tǒng)青年領軍人才9人。其中2023年已來院報到博士52名，博士后進站7名，柔性引進高端人才14名
醫(yī)院學科齊全，綜合診療水平高，共開設40余個臨床醫(yī)技科室，呼吸與危重癥醫(yī)學科獲批2022年國家臨床重點�？平ㄔO項目，擁有腫瘤科、麻醉與圍術期醫(yī)學科、呼吸與危重癥醫(yī)學科、骨科、泌尿外科、腎臟內(nèi)科、血液內(nèi)科、兒科、檢驗科、耳鼻喉頭頸外科、眼科11個省級臨床重點�？�。醫(yī)院為挖掘內(nèi)在潛力，重點培育發(fā)展，著力實施“建名科、樹名醫(yī)”戰(zhàn)略，加大對學科建設的投入和扶持力度，確定康復運動醫(yī)學科、泌尿外科、眼科和放射科等8個院級重點發(fā)展�？�。醫(yī)院以重點學科為依托，整合資源，協(xié)調(diào)發(fā)展，形成具有我院特色的學科建設方向。入選安徽省第十三批“115”產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新團隊，獲批安徽省危重癥呼吸疾病臨床醫(yī)學研究中心和安徽省重點實驗室（麻醉）。2022年，醫(yī)院高分通過了中國血友病診療中心建設項目評審，正式成立安徽省首家血友病診療中心；2021年獲批肝腎器官移植資質以來，已開展腎移植手術47例、肝移植手術13例。積極打造高水平藥物臨床試驗研究（GCP）和轉化醫(yī)學平臺，國家藥監(jiān)局數(shù)據(jù)顯示，2022年我院創(chuàng)新藥物I期臨床試驗項目數(shù)（含BE）排名全國第一（試驗數(shù)79項）。
2022年，醫(yī)院引進的安徽省首臺MAGNETOM Vida 3.0T核磁共振成像設備正式投入使用，為新一代智慧型生命感知型磁共振，配置了業(yè)界首個生命矩陣系統(tǒng)；引進第四代“達芬奇”手術機器人設備正式投入使用；引進安裝新一代高清動態(tài)放射外科全流程智能數(shù)字化平臺直線加速器。
醫(yī)院擁有規(guī)范化的中心實驗室和標本庫，為臨床科研提供了堅實的平臺支撐。近年來，醫(yī)院獲批87項國家自然科學基金項目。主編或參編學術著作130部；發(fā)表學術論文5341篇，其中SCI收錄期刊論文1069篇、最高影響因子高達36.37分，中文核心期刊論文1176篇。
作為安徽醫(yī)科大學直屬附屬教學醫(yī)院，醫(yī)院教學師資充足，設施齊全，建有占地約1000平方米的臨床教學技能培訓中心和教研室用房，是美國心臟協(xié)會（AHA）心血管急救培訓中心、安徽省住院醫(yī)師規(guī)范化培訓基地。2017年，代表安徽醫(yī)科大學組隊參加第八屆全國高等醫(yī)學院校大學生臨床技能競賽，榮獲全國總決賽一等獎。醫(yī)院近年來與美國弗吉尼亞聯(lián)邦大學醫(yī)學院Weil危重研究所，美國德克薩斯大學M.D.安德森癌癥中心、美國加州大學舊金山分校醫(yī)學院等國際一流院校醫(yī)療機構建立了長期科研合作、人才培養(yǎng)和學術交流等方面的關系，不斷提升醫(yī)院青年骨干的臨床專業(yè)能力和科研水平。
自建院以來，安醫(yī)大二附院對內(nèi)致力于強化內(nèi)涵建設、提升管理和服務水平、不斷改善療愈環(huán)境，積極履行公立醫(yī)院的責任和使命。醫(yī)院以省內(nèi)唯一一家JCI認證公立醫(yī)院為平臺，建設國際醫(yī)療部；一體化托管省政府機關醫(yī)院和經(jīng)開區(qū)社區(qū)衛(wèi)生服務中心，打造緊密型城市醫(yī)聯(lián)體，不斷創(chuàng)新高質量發(fā)展新模式。與邵逸夫醫(yī)院、上海兒童醫(yī)學中心等長三角先進醫(yī)院建立戰(zhàn)略協(xié)作關系；醫(yī)院通過不斷提升綜合實力和核心競爭力，推進醫(yī)院醫(yī)教研協(xié)同高質量發(fā)展。對外先后多批次組織醫(yī)療隊員遠赴南也門、南蘇丹，新疆和田、西藏山南等地，圓滿完成援外、援疆、援藏等醫(yī)療任務，同時，醫(yī)院積極選派醫(yī)生參加安徽省健康脫貧“百醫(yī)駐村”任務。醫(yī)院廣大醫(yī)務工作者白衣執(zhí)甲、逆行馳援湖北武漢、孝感、安徽阜陽、蚌埠等地，在抗擊新冠肺炎疫情、為群眾接種新冠疫苗等各項工作中以過硬的業(yè)務素養(yǎng)出色的詮釋了“敬佑生命、救死扶傷、甘于奉獻、大愛無疆”的崇高職業(yè)精神。醫(yī)院一大批優(yōu)秀醫(yī)務工作者先后榮獲全國援外醫(yī)療先進個人、中國好醫(yī)生、中國好人、安徽省優(yōu)秀共產(chǎn)黨員、安徽好人、安徽省五一勞動獎章、安徽省抗擊新冠肺炎疫情先進個人等諸多榮譽稱號。