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廣州醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院（簡稱廣醫(yī)二院）于1982年12月正式掛牌，2004年8月成立廣州醫(yī)學院第二臨床學院。2013年6月醫(yī)院正式更名為廣州醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院，廣州醫(yī)學院第二臨床學院更名為廣州醫(yī)科大學第二臨床學院。經過數(shù)十年的艱苦創(chuàng)業(yè)，醫(yī)院不斷發(fā)展壯大，已發(fā)展成為人才隊伍齊備、學科力量雄厚、醫(yī)療技術精湛、科教成果豐碩、診療設備先進、醫(yī)療服務完善，集醫(yī)療、教學、科研與保健于一體的大型三級甲等綜合性醫(yī)院和高等醫(yī)學院校附屬醫(yī)院，成為廣州市重要的醫(yī)療診治、醫(yī)學教育、醫(yī)學研究機構，廣東省、廣州市干部保健基地。
醫(yī)院由院本部、番禺院區(qū)和西院區(qū)組成。本部位于廣州市海珠區(qū)核心地區(qū)，雙地鐵昌崗站上蓋。醫(yī)院三個院區(qū)總占地面積11.1萬平方米，建筑面積22.95萬平方米，編制床位2500張，設有46個臨床科室，12個醫(yī)技科室，附設廣州醫(yī)科大學神經科學研究所、廣州心血管疾病研究所，以及1個社區(qū)衛(wèi)生服務中心。醫(yī)院現(xiàn)有職工3600余人，300余人次在省、市學術團體各專業(yè)學會擔任主任委員、副主任委員。擁有享受國務院特殊津貼專家5人，新世紀百千萬人才工程國家級人選1人，衛(wèi)生部有突出貢獻中青年專家1人，雙聘院士3人，珠江學者特聘教授1人，廣東省有突出貢獻專家1人，廣東省高等學�！扒О偈�人才培養(yǎng)工程”國家級培養(yǎng)對象1人、省級培養(yǎng)對象2人，廣東省自然科學杰出青年基金獲得者1人，廣東省醫(yī)學領軍人才3人，廣東省杰出青年中醫(yī)藥人才1人。有博士生導師78人，碩士生導師156人。
醫(yī)院學科齊全、技術力量雄厚、�？铺厣�突出，在神經系統(tǒng)疾病、心血管疾病、過敏性疾病、慢性疼痛防治及腎移植、急診救治等領域達到國內先進水平。擁有國家臨床重點專科2個（過敏反應科、疼痛科），“十二五”省級臨床重點�？�16個（過敏反應科、疼痛科、心血管內科、神經外科、重癥醫(yī)學科、神經內科、急診科、普通外科、康復科、醫(yī)學檢驗科、胸外科、腎內科、醫(yī)學影像科、眼科、內分泌科、呼吸內科），廣東省高水平臨床重點�？�3個（過敏反應科、疼痛科、急診科），“十四五”省級臨床重點�？�5個（心血管內科、神經內科、重癥醫(yī)學科、器官移植科、神經外科）。國家臨床藥師培訓專業(yè)基地3個，國家藥物臨床試驗機構備案專業(yè)25個。
醫(yī)院擁有最新一代伽瑪射線立體定位治療系統(tǒng)、全飛秒激光近視治療機、3.0T醫(yī)用核磁共振成像系統(tǒng)、256排全身高速螺旋能譜CT、雙C臂數(shù)字減影血管造影X線機（DSA）、術中放療手術系統(tǒng)、單光子發(fā)射型電子計算機斷層掃描儀（SPECT）、正電子發(fā)射計算機斷層顯像（PETCT）、機器人手術顯微鏡、數(shù)字一體化手術室等一批先進的現(xiàn)代化醫(yī)療設備。
第二臨床學院為廣東省高水平臨床醫(yī)學院，負責廣州醫(yī)科大學臨床醫(yī)學二系、醫(yī)學影像學系、麻醉學系的教學工作，其中臨床醫(yī)學、醫(yī)學影像學為國家級一流本科專業(yè)建設點。承擔了�？�、本科、研究生、住培等多層次的教學任務。擁有一支優(yōu)秀的師資隊伍，我院共有博士生導師77人，碩士生導師152人。內科學教學團隊為國家級優(yōu)秀教學團隊。內科學課程為國家精品課程、國家雙語教學示范課程，還擁有一批省市精品課程。擁有國家住院醫(yī)師規(guī)范化培訓專業(yè)基地27個，普通外科是全國�？漆t(yī)師規(guī)范化培訓制度試點�？婆嘤柣�地，協(xié)同醫(yī)院2家。
臨床醫(yī)學為廣東省教育廳第九輪攀峰重點學科，神經內科為廣東省“十二五”醫(yī)學重點學科，內科學（心血管病與心血管藥理）和臨床檢驗診斷學為廣州市屬高校重點學科，外科學為廣州市屬高校重點扶持學科，急診醫(yī)學、泌尿疾病學為廣州市醫(yī)學重點學科。擁有省部共建教育部重點實驗室1個（神經遺傳與離子通道病重點實驗室）、廣東省重點實驗室2個、廣東省教育廳重點實驗室3個、廣東省衛(wèi)生健康委重點實驗室1個、廣州市重點實驗室4個。近五年來，獲得科研經費2.5億余元，獲得各級科研項目700余項，其中國家自然科學基金項目87項（包括聯(lián)合基金項目1項）。
醫(yī)院堅持“以病人為中心”的辦院宗旨，堅守“仁愛、精誠、團結、創(chuàng)新”的院訓，發(fā)揚“艱苦創(chuàng)業(yè)、求真務實、勇于開拓”的廣醫(yī)二院人精神，實行全方位優(yōu)質醫(yī)療服務。以“更好的質量、更好的服務、更好的環(huán)境、更合理的費用”為目標，精益求精，追求卓越。以嚴謹?shù)淖黠L、精湛的醫(yī)術、優(yōu)質的服務，贏得了廣大人民群眾的信任，病人遍及省內外、港澳臺和東南亞等國家和地區(qū)。醫(yī)院被國家衛(wèi)生部評為“三級甲等醫(yī)院”、“愛嬰醫(yī)院”和“全國衛(wèi)生系統(tǒng)先進集體”，榮獲廣東省“文明醫(yī)院”、“百家文明醫(yī)院”、“白求恩式先進集體”及“廣州市文明單位標兵”、“廣州市最受歡迎三甲醫(yī)院”、“廣州市醫(yī)保信用‘AAA’級定點醫(yī)療機構”等榮譽稱號。
番禺院區(qū)位于廣州市番禺區(qū)亞運城，前身為“廣州醫(yī)科大學附屬第四醫(yī)院”，2016年經廣州市機構編制委員會和廣州醫(yī)科大學批準，整體并入廣醫(yī)二院。番禺院區(qū)占地面積82畝，建筑面積6.6萬平方米，編制床位500張。番禺院區(qū)以“小綜合、大�？啤睘閷�向，重點打造器官移植中心、心腦血管疾病防治中心、創(chuàng)傷救治中心和腫瘤防治中心，是廣州南部地區(qū)醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)重要支撐力量。
西院區(qū)位于廣州市海珠區(qū)廣紙路，前身為“廣紙醫(yī)院”，2012年經廣州市政府批準，整體并入廣醫(yī)二院。設有全科醫(yī)學科、康復科，以及由我院直接管辦的南石頭街社區(qū)衛(wèi)生服務中心，西院區(qū)重點打造成為全國高水平衛(wèi)生服務中心和全科醫(yī)學培訓示范性基地，做大做強緊密型醫(yī)聯(lián)體的“廣醫(yī)二院模式”。2018年1月，南石頭街社區(qū)衛(wèi)生服務中心被國家衛(wèi)生和計劃生育委員會授予“優(yōu)質服務示范社區(qū)衛(wèi)生服務中心”。